細(xì)胞免疫是控制細(xì)胞內(nèi)病原體的關(guān)鍵，但在進(jìn)化的人類免疫反應(yīng)中，個(gè)體細(xì)胞動(dòng)力學(xué)和細(xì)胞-細(xì)胞協(xié)同性仍然知之甚少。單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)是一個(gè)強(qiáng)有力的工具，可以用來(lái)分析健康和疾病中復(fù)雜的多細(xì)胞行為，并鑒定可測(cè)試的治療靶點(diǎn)。將其應(yīng)用于縱向樣本可以提供一個(gè)揭示與疾病進(jìn)展演變相關(guān)的細(xì)胞因子的機(jī)會(huì)，而不會(huì)潛在地混淆個(gè)體間的多樣性。

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為此來(lái)自哈佛和MIT等單位的研究人員提出了一種實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，使用scRNA-seq來(lái)描述動(dòng)態(tài)細(xì)胞程序及其分子驅(qū)動(dòng)因素，并將其應(yīng)用于HIV感染。通過(guò)對(duì)急性感染前和急性感染期間的四個(gè)未治療個(gè)體的外周血單核細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq檢測(cè)，研究人員在每個(gè)個(gè)體內(nèi)部發(fā)現(xiàn)了隨時(shí)間和細(xì)胞亞群而變化的基因反應(yīng)模塊，相關(guān)研究成果于近日發(fā)表在Nature Medicien上，題為"Integrated single-cell analysis of multicellular immune dynamics during hyperacute HIV-1 infection"。

除了先前未被發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞類型特異的干擾素刺激基因上調(diào)，研究人員還描述了在批量測(cè)試中難以觀察到的瞬時(shí)基因表達(dá)反應(yīng)，包括那些參與促炎的T細(xì)胞分化，單核細(xì)胞主要組織相容性復(fù)合體II上調(diào)延長(zhǎng)和持久的自然殺傷(NK)細(xì)胞的細(xì)胞溶解能力。

研究人員進(jìn)一步確定了在感染的最初幾周內(nèi)出現(xiàn)的反應(yīng)特征，例如增殖的自然殺傷細(xì)胞，這可能與未來(lái)的病毒控制有關(guān)。總之，這項(xiàng)研究提出的方法提供了一個(gè)統(tǒng)一的框架來(lái)描述多種動(dòng)態(tài)細(xì)胞反應(yīng)及其相互協(xié)調(diào)。（生物谷Bioon.com）

小編推薦會(huì)議 2021 （第四屆）單細(xì)胞多組學(xué)研究與臨床應(yīng)用峰會(huì)

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