
3D打印的許多優(yōu)點(diǎn)使得各行業(yè)在發(fā)展中取得創(chuàng)新性進(jìn)展。盡管研究人員和制造商對操縱3D領(lǐng)域進(jìn)行生物打印、創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)室和醫(yī)療設(shè)備等等更感興趣,但醫(yī)學(xué)領(lǐng)域正在取得一些最不可否認(rèn)的重大影響。隨著研究人員不斷深入研究,他們在提高全球患者的生活質(zhì)量方面取得更大成功,其中包括使用微流控裝置。
NYGC研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備
NYGC研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備
現(xiàn)在,紐約基因組中心(NYGC)和紐約大學(xué)(NYU)的研究人員開發(fā)出了一種更經(jīng)濟(jì)、廣泛的單細(xì)胞分析方法,并創(chuàng)建了3D打印的微流控制器。這種便攜式設(shè)備相當(dāng)于紙巾盒的大小,已經(jīng)被RA研究和治療的領(lǐng)導(dǎo)者特殊外科醫(yī)院(HSS)用于研究類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)患者。
“大多數(shù)商業(yè)微流控制器都非常昂貴。因此,并非每個實(shí)驗(yàn)室都能獲得令人興奮的單細(xì)胞分析技術(shù)。我們設(shè)計(jì)了該儀器以執(zhí)行液滴微流體學(xué),特別是用于單細(xì)胞RNA測序的大規(guī)模并行技術(shù)Drop-seq,“該研究的主要作者、負(fù)責(zé)該儀器開發(fā)的NYGC技術(shù)創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室高級研究工程師William Stephenson博士說道。
NYGC研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備
NYGC研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備
該研究以及關(guān)于新器械的解釋在最近發(fā)表的題為“Single-cell RNA-seq of rheumatoid arthritis synovial tissue using low-cost microfluidic instrumentation.”的論文中得到概述。研究人員能夠測序總共20,387個單細(xì)胞,從而產(chǎn)生13個不同轉(zhuǎn)錄組的簇。
“這個數(shù)據(jù)集使我們有機(jī)會確定可以驅(qū)動RA進(jìn)展的單個細(xì)胞亞群,即使它們以前沒有被鑒定過。”NYGC的核心教員、紐約大學(xué)生物學(xué)助理教授、該研究的資深作者Rahul Satija博士說。
該設(shè)備不僅易于使用,而且是開放源代碼的,可以使用液滴微流體進(jìn)行各種不同的實(shí)驗(yàn)。
“該儀器由固定在3D打印框架上的電子元件和氣動元件組成。整個系統(tǒng)通過在觸摸屏上使用圖形用戶界面的軟件進(jìn)行操作控制。該儀器只需要一個標(biāo)準(zhǔn)的墻上電源插座,占地面積非常小;小到足以安裝在臺式或生物防護(hù)罩上,“研究人員在他們的論文中指出。
“構(gòu)建儀器的材料總成本約為575美元。與分別基于研究級別的注射泵的微流體裝置和商業(yè)微流體平臺相比,這代表了成本降低約20倍和200倍。“
在研究期間,科學(xué)家們特別著迷于這13組中基因表達(dá)模式的差異。
“手術(shù)切除后大約一小時,來自患者組織的單個細(xì)胞被標(biāo)記為單細(xì)胞測序。從這項(xiàng)工作中,我們已將未被識別的成纖維細(xì)胞亞型歸類為可能被證實(shí)為RA患者的重要藥物靶標(biāo),”HSS精密醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室助理教授、威爾康乃爾醫(yī)學(xué)院的副主任和主要作者Laura Donlin說。
通過流式細(xì)胞儀,研究小組能夠確認(rèn)這些新組的存在,同時意識到它們在RA患者中表現(xiàn)出與關(guān)節(jié)組織“不同的局部化模式”。
NYGC研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備
NYGC研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備
研究人員繼續(xù)致力于為滑膜組織制作全細(xì)胞圖譜,他們還計(jì)劃:
收集其他患有類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的患者的數(shù)據(jù);
探索顯示銀屑病關(guān)節(jié)炎和骨關(guān)節(jié)炎等疾病的樣本;
使用專門技術(shù)(CITE-seq)評估表面蛋白來分類細(xì)胞類型;
檢查樣本,例如那些顯示傳染性疾病的研究,這些研究在標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室中會更困難;
“我們希望該儀器能夠降低與在基礎(chǔ)研究和臨床環(huán)境中進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)驗(yàn)相關(guān)的障礙,”Stephenson博士說。
NYGC是一家致力于生物醫(yī)學(xué)研究和臨床護(hù)理的非營利學(xué)習(xí)和研究機(jī)構(gòu)。NYGC制作的作品的目標(biāo)是最終利用基因組研究來改進(jìn)人類疾病診斷和治療。(世聯(lián)博研(Bioexcellence)世聯(lián)博研Bioexcellence)
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