藥明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上發表創新型研究論文，結果證明可提供一種潛在的新穎方法診斷慢性病毒感染。

藥明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 在《Nature Genetics》上發表論文，介紹診斷病毒感染的新方法（圖片來源：《Nature Genetics》）

Adaptive Biotechnologies 是高通量測序領域的先驅性公司和領軍企業之一，其專長于結合生物信息學來鑒定分析 T 細胞和 B 細胞受體。這家公司的 immunoSEQ 平臺幫助科研人員在腫瘤學、自身免疫疾病、傳染病和基礎免疫學等領域展開前沿研究。以服務或試劑盒形式，immunoSEQ 測定方法可以高度精細地從單個樣品中鑒定分析數百萬個 T 細胞和 B 細胞受體。該 immunoSEQ 平臺分析工具可提供定量、可重復的測序結果，加上其強大的訪問功能以及易于使用的特性，Adaptive 免疫測序平臺的準確性和靈敏度優勢已經逐步入駐世界各地的實驗室，推動癌癥和其他免疫介導疾病的突破性研究；同時，該公司也將免疫測序發現轉化為臨床診斷和治療手段，以改善患者的護理水平。

Adaptive 結合生物信息學鑒定免疫細胞受體分析（圖片來源：Adaptive 官網）

這篇題為“Immunosequencing identifies signatures of cytomegalovirus exposure history and HLA-mediated effects on the T cell repertoire”的文章正是描述了 Adaptive 的計算生物學家如何使用該公司的 immunoSEQ 平臺和數據集，通過免疫測序手段來確定分析 T 細胞受體譜系，最終用于診斷人類巨細胞病毒（CMV）感染的暴露狀態。

Adaptive 的這項研究是由 Fred Hutchinson 癌癥研究中心部分資助的。研究共同作者選擇了 CMV 進行原理驗證實驗，這是因為該疾病約占成年人慢性病毒感染的 30%？90%，并被廣泛研究后建立成為公眾人群 T 細胞應答的模型系統。使用公共數據，Adaptive 的研究團隊分析了 666 名受試者核心隊列的 T 細胞受體全譜系，以及另外 120 名受試者的獨立驗證隊列。研究小組制定了一個統計計算框架，通過 CMV 感染狀態對受試者進行分類，然后高精度確認了免疫測序方法可被用于診斷 CMV 的感染狀態。此外，該團隊使用這種方法證明它在預測受試者的人類白細胞抗原（HLA）等位基因方面也表現良好，表明該方法可用于識別暴露于其他病原體的生物標志，甚至疫苗接種狀態。

Adaptive 的聯合創始人兼創新主管 Harlan Robins 博士（圖片來源：Adaptive 官網）

Adaptive Biotechnologies 的聯合創始人兼創新主管 Harlan Robins 博士說道：“我們認為通過讀取 T 細胞記憶來推斷病原體暴露歷史的方法具有令人興奮的潛力。這是一個重要步驟，我們旨在將免疫測序驗證為針對各種慢性病毒感染的高敏感度、高特異性和高效益的診斷方法。”（生物谷 Bioon.com）

原文出處：

Emerson RO et al.Immunosequencing identifies signatures of cytomegalovirus exposure history and HLA-mediated effects on the T cell repertoire，Nat Genet.(2017).DOI：10.1038/ng.3822.