近日,上海交通大學丁顯廷教授和謝海洋助理研究員團隊在Advanced Materials雜志上發表論文,報道了一種基于微芯片免疫印跡方法的單細胞轉染效率分析芯片(scTAC),用于快速準確地分析數千個宿主細胞個體中外源基因的表達差異。scTAC不僅可以對單個細胞中外源基因表達活性的信息進行靈敏、快速、準確的分析,還可以用于稀有細胞轉染效率的分析和轉染方法的評
近日,上海交通大學丁顯廷教授和謝海洋助理研究員團隊在Advanced Materials雜志上發表論文,報道了一種基于微芯片免疫印跡方法的單細胞轉染效率分析芯片(scTAC),用于快速準確地分析數千個宿主細胞個體中外源基因的表達差異。scTAC不僅可以對單個細胞中外源基因表達活性的信息進行靈敏、快速、準確的分析,還可以用于稀有細胞轉染效率的分析和轉染方法的評估。
轉染是細胞生物學中研究特定基因功能的基本方法。構建具有熒光蛋白標簽的融合蛋白,對于評估基因編輯效率,追蹤蛋白信號以及無損研究細胞生物學功能(例如細胞周期)至關重要。然而,即使在成功轉染的細胞中,由于復雜的酶環境和蛋白翻譯修飾機制,融合基因的不完全共表達情況會產生廣泛的假陽性信號。同時,外源基因的表達產物在不同的細胞階段呈現出高度的動態變化特性,造成轉染細胞個體基因表達的異質性。此外,對于一些難以轉染的細胞,如腫瘤干細胞、基因編輯細胞,由于細胞數量極為稀少,難以采用傳統的方法如Western Blot、熒光流式分選技術分析相關基因表達信息。這些問題對現有的細胞轉染技術中結果的可靠性,轉染方法的有效性和準確性構成嚴峻挑戰。
為了解決這些難題,該研究報道了一種單細胞轉染效率分析芯片(scTAC),每個芯片有2000個微孔陣列,多個芯片并行可以實現高通量檢測,能夠從成千上萬個細胞中迅速篩選已成功轉染的細胞,并可對單細胞中的外源基因的共表達情況進行準確分析,還可對細胞內相關信號通路中蛋白質表達進行分析。
該研究報道了利用scTAC對轉染后的細胞進行精確定位,通過分析熒光蛋白和靶蛋白的表達強度,得出靶蛋白的表達與熒光蛋白的表達并非總是具有一致性,從而說明傳統方法中使用熒光蛋白進行靶蛋白表達水平評估結果的不可靠性。(生物谷世聯博研Bioexcellence)
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