為了初步探討新生兒出生后第1天和第3天腸道微生態中菌群分布的特點，同濟大學附屬第一婦嬰保健院丁溢芳， 肖玲莉， 郭佳林， 等人選取2016年6月15日至2016年8月3日在同濟大學附屬第一婦嬰保健院出生的50例單胎、健康新生兒為研究對象。采集新生兒糞便樣本，按采集時間分為第1天（記為D1）組和第3天（D3）組，每組各50個。使用Illumina NexSeq高通量測序技術，對樣本中所有細菌的16S rRNA基因的V4+V5區進行DNA測序，獲得腸道菌群結構數據。

結果發現：100個糞便樣本共檢測到門25個，科119個，屬227個，種159個。2組糞便樣本中主要的門均為變形菌門、厚壁菌門、擬桿菌門和放線菌門。與D1組相比，D3組中厚壁菌門、擬桿菌門的相對豐度呈上升趨勢（分別為0.27±0.03與0.41±0.05、0.07±0.01與0.09±0.03），放線菌門呈下降趨勢（0.10±0.01與0.01±0.00），變形菌門變化不大（0.51±0.03與0.49±0.05）。2組的厚壁菌門、放線菌門的相對豐度比較，差異均有統計學意義（q值均為－0.01，P值均<0.05）。2組糞便樣本中相對豐度前10的共有科為腸桿菌科、葡萄球菌科、腸球菌科、鏈球菌科和毛螺菌科。與D1組相比，D3組中腸桿菌科、葡萄球菌科、腸球菌科、鏈球菌科的相對豐度呈上升趨勢（分別為0.25±0.02與0.46±0.06、0.07±0.02與0.12±0.03、0.04±0.02與0.10±0.04、0.03±0.02與0.06±0.01），毛螺菌科呈下降趨勢（0.03±0.01與0.02±0.02）。2組中只有腸桿菌科相對豐度比較差異有統計學意義（q=0.00，P<0.05）。2組糞便樣本中相對豐度前10的共有屬為葡萄球菌屬、腸球菌屬、鏈球菌屬、擬桿菌屬和假單胞菌屬。與D1組相比，D3組中寡養單胞菌屬、丙酸桿菌屬、不動桿菌屬、芽孢桿菌屬、鞘氨醇單胞菌屬等需氧或兼性厭氧菌的相對豐度降低（分別為0.07±0.02與0.00±0.00、0.06±0.01與0.00±0.00、0.03±0.01與0.00±0.00、0.02±0.01與0.00±0.00、0.02±0.00與0.00±0.00，q值均為0.00，P值均<0.05），擬桿菌屬、韋榮球菌屬、副擬桿菌屬等厭氧菌的相對豐度升高（分別為0.01±0.00與0.08±0.03、0.00±0.00與0.03±0.02、0.00±0.00與0.01±0.00，q值分別為0.01、0.01及0.00，P值均<0.05）。

2組中相對豐度最高的菌種均為大腸埃希菌，均可見少量的加氏乳桿菌、動物乳桿菌和兩岐雙歧桿菌。生后第1天的糞便樣本，按分娩方式分為陰道分娩亞組和剖宮產亞組。2個亞組中相對豐度最高的屬均為葡萄球菌屬，其次為寡養單胞菌屬。生后第3天糞便樣本，按分娩方式和喂養方式分為陰道分娩+非純母乳喂養亞組、陰道分娩+純母乳喂養亞組、剖宮產+非純母乳喂養亞組和剖宮產+純母乳喂養亞組。其中，剖宮產+純母乳喂養亞組以葡萄球菌屬為絕對優勢菌，與其他3個亞組（均以腸球菌屬、擬桿菌屬、鏈球菌屬、葡萄球菌屬為主要優勢菌屬）不同；而雙歧桿菌屬及Subdoligranulum僅出現在陰道分娩的新生兒糞便樣本。

胎糞并非無菌，且生后3 d內的糞便雖然菌群構成不同，但有共有優勢菌。同時，與生后第1天相比，生后第3天需氧或兼性厭氧菌的相對豐度逐漸下降，而厭氧菌的相對豐度逐漸上升。(生物谷Bioon.com）

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