腸道菌群與健康的關聯，近年來得到了越來越多科學研究的探索。與此同時，益生菌多年來也熱度不減，《柳葉刀》子刊社論曾指出，益生菌的商業和臨床使用甚至比科學證據的發展“跑得更快”。

在對現有文獻進行詳細回顧后，美國胃腸病學會（AGA）在其官方期刊《胃腸病學》（Gastroenterology）發布了最新臨床指南。AGA強調，對于大多數消化系統疾病，“非常缺乏證據”支持益生菌的使用。

據AGA介紹，這是第一份針對益生菌在多種胃腸道疾病中的應用的臨床指南，同時也考慮了每種單獨的菌株或多種菌株制劑的效果，而不是將它們全部簡單統一歸為“益生菌”。

鑒于益生菌被廣泛應用，而且大眾獲得的信息來源經常不準確，為了提供客觀的信息指導益生菌的適應癥和正確應用，AGA使用了金標準GRADE方法來評估證據質量并以此制定指南。

指南僅支持在三種臨床情況下使用某些益生菌制劑，在這些情況下，現有數據表明益生菌可以使患者受益。

在服用抗生素的成人和兒童中，預防艱難梭菌（C. difficile）感染。

預防早產，低出生體重嬰兒的壞死性小腸結腸炎。

治療結腸貯袋炎（pouchitis），這是炎癥性腸病的一種并發癥。

指南專家小組主席，密西根大學（University of Michigan）Grace L. Su博士表示，“雖然指南中確實提出了一些益生菌適用的情況，但更重要的是，提醒大眾，他們對益生菌益處的‘想象’，往往沒有充分依據，而且益生菌產品配方的不同也會對臨床結果帶來重大影響。”

指南關鍵建議如下：

1. 對于艱難梭菌感染，患有克羅恩病、潰瘍性結腸炎或腸易激綜合征的成人和兒童，僅建議在臨床試驗中服用益生菌。（缺乏證據，現有信息不足以做出治療推薦）

AGA建議，對于這些患者來說，如果正在服用益生菌，則應該考慮停用。這些補充劑會帶來額外花費，但沒有足夠的證據證明它們有益或無害。

2. 接受抗生素治療的成人和兒童，建議使用特定益生菌來預防艱難梭菌感染。包括鮑氏酵母菌（S. boulardii）等特定益生菌。

對于高度擔心益生菌風險和成本，或艱難梭菌感染風險極低的患者，可以合理選擇不使用益生菌。（有條件推薦，證據等級低）

3. 對于出現結腸貯袋炎（潰瘍性結腸炎的并發癥）的成人和兒童，建議使用8種特定菌株的組合。

對于用藥不便或對成本有顧慮的患者，可以合理選擇不使用益生菌。（有條件推薦，證據等級很低）

4. 對于患有急性腸胃炎的兒童，不建議使用益生菌。（有條件推薦，證據質量中等）

5. 對于早產（＜37周）、體重不足（<2500克）的嬰兒，特定的益生菌可以預防死亡、預防壞死性小腸結腸炎，減少實現完全喂養所需的天數，并減少住院時間。益生菌包括乳酸桿菌屬（Lactobacillus spp.）和雙歧桿菌屬（Bifidobacterium spp.）的組合，或動物雙歧桿菌（B. animalis subsp.lactis），或羅伊氏乳桿菌（L. reuteri），或鼠李糖乳桿菌（L. rhamnosus）。（有條件推薦，證據質量中等/高）

指南指出，胃腸病學家應僅在有明顯益處的情況下才建議患者使用益生菌，并應認識到益生菌的作用會隨著具體菌株和組合而不同。目前，行業仍然需要更多精心設計的臨床試驗來探索益生菌在消化道相關疾病中的應用、從而幫助完善AGA關于益生菌的建議。(生物谷世聯博研Bioexcellence）

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